Hundred
Ketika organisme luar angkasa yang dikenal sebagai "Savage" menyerang umat manusia, satu-satunya teknologi yang mampu melawan musuh adalah senjata yang disebut "Hundred." Seorang penyintas serangan Savage, Hayato Kisaragi, adalah remaja dengan tingkat kompatibilitas tertinggi terhadap teknologi tersebut. Karena itu, ia diundang untuk mengasah kemampuannya di Little Garden, akademi militer bergengsi yang berada di atas kapal perang. Selama menjalani pelatihan intensif untuk pertempuran yang akan datang, ia segera menarik perhatian beberapa teman perempuannya dan terlibat dalam berbagai insiden saat berusaha melawan makhluk-makhluk yang kini menghuni Bumi dan mengancam keselamatan umat manusia.